Häufige Ursachen für DNA-Fragmentierung können auf verschiedene Erkrankungen/ Gegebenheiten zurückgeführt werden, wie z.B.: Infektionen, Rauchen, Hitze, Stress, verschreibungspflichtige Medikamente, Drogenkonsum und Pestizide neben weiteren aufgeführten Ursachen. Manchmal kann die Reduzierung oder Entfernung des möglichen Mitwirkenden die erhöhten DNA-Fragmentierungsgrade reduzieren.